FOSDEM,每年在比利时布鲁塞尔举行,是一个供开源社区聚会、分享想法和协作的免费活动。它结合了专注的专题讨论室和主题主会场演讲,无需注册。它以高度关注开发者而闻名,今年汇集了来自世界各地的 5000 多名技术爱好者。
自从我参与开源以来,很明显,这些社区对科学很感兴趣,因此存在交叉合作的机会。今年是 FOSDEM 首次设立专门针对科学家的 FOSS 的专题讨论室。多位演讲者讨论了开放科学的不同方面
- 打包
- 医学影像
- 质谱分析
- 计算化学
- 图划分
- 图像处理
- 支持实际实验的软件
- 高容量 IO
- 数学库
- 高性能计算的系统抽象
- 气候预测
- 倡导科学自由
注意:幻灯片可在 FOSDEM 网站上找到。
演讲很受欢迎,专题讨论室整天都挤满了人。贯穿全天的一个主题是,由于开源的日益普及和发展,科学领域正在发生变化;并且没有任何放缓的迹象,恰恰相反。
越来越多的科学家正在思考,在一个日益数字化的世界中,数据量越来越大,我们应该如何解决可重复性和共享问题。一些领域受到专有格式或许多非标准且文档记录不完善的格式的扩散之苦。共享可能存在许多障碍,当涉及的科学仪器非常昂贵时,短期内很难做出改变。
人们越来越认识到,没有开源、开放数据、开放获取和开放标准,可重复性是不可行的。 显然,为软件基础设施获得资金是一个复杂的过程,而且往往无法实现,并且在有时非常高的设备成本面前,共享软件基础设施往往被忽视。此外,随着科学计算密集度的提高,投资和共享可以重用和扩展的通用代码库将变得更加重要。
第二天的主题演讲涉及各种主题,例如开源机器人技术和车辆中的开源软件。Bill Hoffman 发表了题为:开放科学、开放软件和可重复的代码的演讲,在主会场之一进行。他介绍了这个主题,谈到了科学论述的历史,并继续讨论了我们当前在科学文化中面临的问题,在这种文化中,引用胜过可重复性。如果我们无法获取输入数据,重复所采取的步骤,检查算法的实现,并获得相同的结果,那么发表科学成果有什么意义呢?
随着我们向前迈进,计算机程序正在迅速取代数学成为科学的语言,如果你不必展示你的工作,我们如何评估你的研究?开源社区已经提到开源开发类似于同行评审的科学理想,并在他人的科学工作基础上构建,但现在看来科学可以向开源社区学习。
在这些会议期间,观众提出了许多问题,询问问题是缺乏基础设施、资金还是缺乏社会动机。 回答涉及
- Github、SourceForge 和 Google Code 表明共享代码很容易。
- 出版业不应赚取巨额利润,并支持像 SOPA 这样的倡议以维持其地位。
- 引用的数量和期刊本身不应比代码、数据和结果是否可以被他人重现和/或重用更重要。
非常感谢 FOSDEM 的组织者以及科学家的 FOSS 专题讨论室。
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