Luis Ibanez

5301 积分
User profile image.
Chicago, IL

Luis Ibáñez 在 Google Inc. 芝加哥分公司担任高级软件工程师。本网站表达的观点仅代表他个人。您可以在 github 上找到他: http://www.github.com/luisibanezand,在 twitter 上: http://www.twitter.com/luisibanezHe。他之前曾在 Kitware Inc. 担任技术主管,并在 Open Source EHR Agent (OSEHRA) 担任开源社区发展总监。在 Kitware,他密切参与了医疗影像应用开源软件的开发,特别是 Insight Toolkit (ITK) 的工作。Luis 是开放获取的坚定支持者,并且是 Insight Journal 的编辑之一,Insight Journal 是一份强制验证可重复性的 OA 期刊。Luis 与其他讲师合作,在 2007 年至 2013 年间在 RPI 教授开源软件实践课程,并在 2011 年至 2014 年间在纽约州立大学奥尔巴尼分校教授该课程。Luis Ibáñez 于 1989 年在哥伦比亚布卡拉曼加的桑坦德工业大学获得物理学学士学位,并于 1994 年在同一所大学获得光学硕士学位。他分别于 1995 年和 2000 年在法国雷恩第一大学获得 D.E.A 和博士学位。1999 年,Luis Ibáñez 加入了北卡罗来纳大学教堂山分校神经外科部门,并作为 MIDAG 和 CADDLab 小组的成员参与工作。他在 UNC 的工作与应用于图像引导手术的 2D 和 3D 配准算法的开发有关。他还作为 INSIGHT Registration and Segmentation Toolkit 的开发者参与其中,该工具包由美国国家医学图书馆赞助。Luis Ibáñez 于 2002 年 2 月加入 Kitware, Inc.,在那里他是 Insight Toolkit (ITK) 的主要开发者之一,与其它开发者和用户社区协调其维护工作;他也是 Image Guided Surgery Toolkit (IGSTK) 的主要开发者之一,并参与制定了 Insight Journal 的运营原则。Luis Ibáñez 是开放获取和科学出版物可重复性验证的坚定支持者,并且是 ITK 培训课程和传播开源原则的活动中的常客。2014 年 8 月,Luis 加入 Google Inc. 担任软件工程师,在纽约市的公司工程团队工作。

撰写评论

Barry,

您提出了一个非常好的观点,我完全同意您的看法。

问题的主要根源之一是可重复性不是博士培训的正式组成部分。令人难以置信的是,受训的研究人员没有接受科学方法基础知识的教育。他们中很少有人参加关于认识论的正式课程或关于实验设计的课程。

相反,他们接受了关于“发表或灭亡”的误导和腐败文化的非正式误教育,这种文化只服务于出版商的商业模式,并且根本没有回报社会对科学研究的经济投资。研究生从那些善意但被误导的导师和同伴给出的免费“职业建议”中了解到这种“你必须发表……否则就完蛋了”的腐败做法。这形成了一个恶性循环,个人和机构声誉被培养成一种确保未来研究资金的方式。

有一个可重复研究运动正在努力提高人们对这种脱节的认识,并开发工具将可重复性带回科学研究的主流实践中。

例如,本月出版的 IEEE Computer 专门讨论

“可重复研究”
https://#/blog/home/post/358
http://www.computer.org/csdl/mags/cs/2012/04/mcs2012040011-abs.html

大多数会议和期刊都没有将可重复性验证作为其评审过程的一部分的要求。与大多数学术出版领域一样,他们痴迷于“新颖性”(他们把自己与专利局混淆了),并且很少关注出版物的内容是否真实,以及它是否有效。(参见最近关于科学出版物中欺诈的丑闻:http://www.anesth.or.jp/english/pdf/news20120629.pdf,其中一位研究人员设法捏造了 172 篇论文……)

摆脱这种可悲境地的两个关键要素是

a) 对下一代研究人员进行科学方法真实实践的教育。

b) 提供开放工具,让他们可以轻松地将可重复性融入到日常工作中。

对可重复研究的要求必然导致开放科学(开放数据、开源软件、开放获取出版物),因为一个独立的团队为了验证已发表作品的可重复性,首先需要访问数据、软件、参数和报告,这些数据、软件、参数和报告完整地描述了论文中呈现的工作。

以下是 Victoria Stodden 关于这些问题的两个有趣的演讲

“可重复研究:数字管理议程”
http://www.youtube.com/watch?v=zJ-UxoiGSJM

“开放科学峰会主题演讲 2011”
http://www.youtube.com/watch?v=sZIxzTsvWhw&feature=relmfu

有人说,开源是将科学方法应用于软件工程领域的应用。奇怪的是,开源社区回馈科学研究,帮助恢复可重复性在科学中应有的地位的时机已经到来。

Polly,文章写得真好,

自从在《MacroWikinomics》一书中读到 SEMCO 以来,我就对它的方法着迷。

从您提到的许多有趣的点来看,我认为对于当前组织(甚至对于我们许多人来说)最难的是“无情地放弃控制”的概念。即使我们知道这是正确的事情,为了释放创造力,仍然会产生恐惧,因为不确定如果我们不控制它们,事情是否还会发生。

奇怪的是,当我们放弃控制时,那些计划好的事情实际上并没有发生,而是出现更令人兴奋、更具创新性和更有效率的事情来取而代之。

SEMCO 的经济成功令人信服地证明,让人们在工作中找到激情是明智之举。

SEMCO 的网站是一个值得访问的有趣地方。
我喜欢他们的“Out of your mind Committee”(异想天开委员会)
http://www.semco.com.br/en/content.asp?content=4&contentID=604

谢谢您的精彩文章。

© . All rights reserved.