一个新的 Linux 基金会合作项目有可能通过使用开源软件来推动科学进步。
Linux 基金会本周宣布,它将与生命科学信息框架 OpenBEL 合作,OpenBEL 是一个开源软件项目,旨在通过组织捕获、整合、存储和共享生物学知识。
OpenBEL 使用生物表达语言 (BEL),这是一种以可计算形式表示生命科学领域科学发现的语言。BEL 框架允许组织将来自不同来源的发现合并到一个中心位置。这在生命科学领域很有帮助,因为研究人员不一定需要帮助收集数据,而是需要一种方法使他们的数据可以交换和可操作。
OpenBEL 最初由生物标志物发现公司 Selventa 于 2012 年 6 月发布为一个开源项目。OpenBEL 项目负责人 Ted Slater 表示,通过将 OpenBEL 纳入 Linux 基金会的保护伞下,OpenBEL 将能够利用该基金会的协作软件和社区建设方面的专业知识。
“Linux 基金会托管着计算机历史上最大的协作项目:Linux。它是所有开源开发项目衡量自身的标准。我们知道我们的行业可以从这个开源开发和治理的中立管理者那里学到很多东西,”Slater 在一份新闻稿中说。“此外,通过在 Linux 基金会托管 OpenBEL,我们可以获得各种重要的服务,以帮助促进协作开发,使我们的团队能够专注于我们的主题:生命科学。”
Linux 基金会托管着多个与大型企业合作的协作项目,其执行董事 Jim Zemlin 表示,Linux 基金会认为 OpenBEL 是一个可能带来医学和科学突破的开源项目。
“我们所有人集体比我们任何一个人都更聪明,而 Linux 是这一原则最伟大的例子之一。我们能够将我们对 Linux 和协作开发的了解转移到新的行业,”Zemlin 在一份新闻稿中说。“OpenBEL 代表着开放性和协作性在推动科学进步方面的绝佳机会,我们很高兴将我们协作软件开发的知识传授给生命科学行业的领导者。成功的开源项目不仅仅托管代码;它们还充分利用一套完整的开源最佳实践来快速获得采用和协作。我们的目标是帮助 OpenBEL 取得更大的成功。”
要参与 OpenBEL 项目,请访问:http://www.openbel.org
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