在采用数字或开源工具方面落后于其他行业的领域之一是竞争激烈且利润丰厚的科学出版界。根据 Stephen Buranyi 去年在 《卫报》 上发布的数据，该行业年产值超过 190 亿英镑（260 亿美元）。即使在今天，选择、出版和分享最重要的科学研究的系统仍然带有许多印刷媒体的限制。新的数字时代技术为加速发现、使科学更具协作性而非竞争性，以及将基础设施开发的投资重新导向造福社会的研究提供了巨大的机会。
非营利组织 eLife 倡议 由研究资助者发起成立，部分目的是为了鼓励将这些技术用于此目的。除了出版一份关于生命科学和生物医学研究重要进展的开放获取期刊外，eLife 还将自己打造成一个研究传播领域实验和展示创新的平台——其中大部分实验都基于开源精神。
参与开源出版基础设施项目为我们提供了机会，可以加速推广和采用我们认为对学术出版行业发展至关重要的技术和用户体验 (UX) 最佳实践。一般来说，开源产品的 UX 往往未得到充分开发，这在某些情况下会劝退人们使用它。作为我们对 OSS 开发投资的一部分，我们非常重视 UX，以鼓励用户采用这些产品。
我们所有的代码都是开源的，我们积极鼓励社区参与我们的项目，这对我们来说意味着更快的迭代、更多的实验、更高的透明度以及我们工作更广泛的影响力。
我们参与的项目，例如 Libero（前身为 eLife Continuum）和 可重复文档堆栈 的开发，以及我们最近与 Hypothesis 的合作，展示了如何使用 OSS 在新发现的评估、出版和传播方面带来积极变化。
Libero
Libero 是一套为出版商提供的服务和应用程序，包括后期制作出版系统、完整的前端用户界面模式套件、Libero 的 Lens Reader、开放 API 以及搜索和推荐引擎。
去年，我们采用了用户驱动的方法来重新设计 Libero 的前端，从而减少了分散注意力的网站“装饰”，更加专注于研究文章。我们与 eLife 社区的成员一起测试和迭代了网站的所有关键功能区域，以确保为每个人提供最佳的阅读体验。该网站的新 API 还为机器可读性提供了更简单的内容访问，包括文本挖掘、机器学习和在线应用程序开发。
我们网站上的内容和驱动新设计的模式都是开源的，以鼓励 eLife 和其他希望使用它的出版商未来进行产品开发。
可重复文档堆栈
eLife 还与 Substance 和 Stencila 合作，参与了一个创建可重复文档堆栈 (RDS) 的项目——这是一个用于在线创作、编译和发布计算可重复稿件的开放工具堆栈。
如今，越来越多的研究人员能够通过 R Markdown 和 Python 等语言记录他们的计算实验。这些可以作为实验记录的重要组成部分，虽然它们可以独立于或与由此产生的研究文章一起共享，但传统的出版工作流程往往会将这些资产降级为次要内容。为了发表论文，使用这些语言的研究人员通常别无选择，只能以图形的形式提交他们的计算结果作为“扁平化”输出，从而失去了计算中使用的代码和数据参考的许多价值和可重用性。虽然诸如 Jupyter 等电子笔记本解决方案可以让研究人员以易于重用和可执行的形式发布他们的代码，但这仍然是作为已发表稿件的补充，而不是作为其组成部分。
可重复文档堆栈 项目旨在通过开发和发布可重复稿件的工作原型来应对这些挑战，该原型将代码和数据视为文档的组成部分，展示了从创作到出版的完整端到端技术堆栈。它最终将允许作者以包含嵌入式代码块和计算输出（统计结果、表格或图表）的格式提交他们的稿件，并使这些资产在整个出版过程中保持可见和可执行。出版商将能够直接将这些资产作为已发布的在线文章的组成部分保存下来。
使用 Hypothesis 进行开放注释
最近，我们与 Hypothesis 合作引入了开放注释，使用户能够在我们网站上发表评论、突出显示文章的重要部分，并与在线阅读公众互动。
通过这次合作，开源 Hypothesis 软件定制了新的审核功能、单点登录身份验证和用户界面自定义选项，使出版商可以更好地控制其在他们网站上的实施。这些增强功能已经推动了围绕已发表学术内容更高质量的讨论。
该工具可以无缝集成到出版商的网站中，学术出版平台 PubFactory 和内容解决方案提供商 Ingenta 已经开始利用其改进的功能集。HighWire 和 Silverchair 也正在为他们的出版商提供实施该服务的机会。
其他行业和开源
随着时间的推移，我们希望看到更多出版商采用 Hypothesis、Libero 和其他项目，以帮助他们促进重要科学研究的发现和重用。但 eLife 因为这些和其他 OSS 技术而能够利用的创新机会在其他行业也很普遍。
如果没有高质量、良好支持的开源软件以及围绕它建立的社区，数据科学领域将寸步难行；TensorFlow 是这方面的一个典型例子。由于 OSS 及其社区，与计算的其他领域相比，人工智能和机器学习的所有领域都实现了快速加速和进步。类似的是 Linux 作为云 Web 主机的使用量激增，其次是使用 Docker 进行容器化，现在 Kubernetes 也实现了增长，Kubernetes 是 GitHub 上最受欢迎的开源项目之一。
所有这些技术都使组织能够事半功倍，并专注于创新，而不是重复造轮子。归根结底，这就是 OSS 的真正好处：它让我们所有人都能从彼此的失败中学习，同时在彼此的成功基础上再接再厉。
我们一直在寻找机会与研究和技术交叉领域最优秀的新兴人才和想法进行交流。在 eLife Labs 上了解更多关于这些交流的信息，或联系 innovation@elifesciences.org 获取更多信息。
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