在关于在研究中使用开源系列的第一部分中,我介绍了 LibreOffice、LaTeX 以及两个用于心理学实验的软件包。在本文中,我将向您展示帮助处理论文数据和传播结果的软件。
分析您的数据
习惯使用 SPSS 的人可能希望看看两个程序。PSPP 非常相似,甚至包括相同的菜单,但它是免费的且更易于安装。它也使用相同的文件格式,因此在 SPSS 中现有的工作应该可以在 PSPP 中完美打开。另一个是新的软件包 JASP,它自称为“SPSS 的低脂替代品”。JASP 具有非常吸引人的界面,您每次点击都会获得即时输出,这意味着可以纠正错误,而无需再次浏览多个窗口。复杂的分析可能涉及大量的试错来探索对输出的影响,因此这是一个主要的节省时间的方法。JASP 处理贝叶斯分析和经典分析,并且因为它是由心理学研究人员开发的,所以输出表已经是 APA6 格式,可以直接剪切并粘贴到您的研究文档中。
然而,最强大的免费和开源 (FOSS) 统计程序是 R。R 最初是统计语言 S 的 FOSS 版本,在过去几年中显示出爆炸性增长,大约有 7,000 个附加软件包可用于处理几乎任何统计要求,并且越来越多的书籍、课程和博客(例如 R-bloggers)专注于实际应用。一些网站专门关注如何将 R 用于心理学研究——一个例子是 William Revelle 的 人格项目,该项目还提供一个名为 psych 的 R 包,这是一个用于人格、心理测量学和实验心理学的工具箱。
R 的主要优势之一是您可以将一系列命令写入文件,然后 R 将依次运行所有命令,这意味着可以使用一个命令再次运行整个分析,而无需在多个屏幕上点击。(虽然您可以使用 SPSS 的“语法”功能做类似的事情,但它没有那么通用。)一个名为 knitr 的 LaTeX 包允许将 R 代码集成到 LaTeX 中,这样,如果您编辑数据,论文中现有的表格和图表将自动重新创建以显示新数据。
然而,强大的功能是有代价的,R 的学习曲线出了名的陡峭。像我这样的初学者可以看看像 mosaic 或 swirl 这样的 R 包,它们可以温和地向新用户介绍 R,以及 RStudio 界面,这使得输入 R 命令更容易。
研究协作
许多从事小组工作或与合作者撰写论文的人都使用过文字处理器文档中的修订模式功能来识别谁更改了文本的哪些部分。根据我的经验,这样做很快就会导致颜色、删除线和下划线混乱不堪。另一种选择是让每个合作者以新文件名分发其更改后的文档的保存副本,但在这种情况下,您最终必须手动检查 Bob 的 2 月 11 日副本是否包含 Alice 在 2 月 9 日副本上分发的更改。
一个更好的方法是使用版本控制。这会记录对文档所做的所有更改,以便您可以在必要时撤消它们,或者回溯到早期版本,当您意识到您花费大量时间修改的讨论不如您想象的那么好时。最重要的是,每个人都在使用文档的单个最新副本进行工作,这意味着每个人都清楚地知道项目在任何给定时间的进展。
版本控制最适用于文本文件,这本身就是使用 LaTeX 文件或 R 脚本而不是文字处理器文档或电子表格的充分理由。最流行的版本控制系统是 Git,如果您正在与您所在位置以外的研究人员合作,那么将存储库存储在 Web 上是有意义的。您可能会接受任何人都可以查看文件的公共存储库,但是如果您正在研究一个您想暂时保密的出色的新想法,您可能需要一个私有存储库。选项包括 GitHub,公共存储库是免费的,但私有存储库需要付费,或者 Bitbucket,这两种类型都是免费的。GitHub 和 Bitbucket 都为 Microsoft Windows 或 Apple Mac OSX 提供界面程序,或者后者的用户可以使用 GitUp。
分享和展示您的工作
LibreOffice 包含一个演示程序,但我更喜欢将 LaTeX 与 beamer 包一起使用。主要好处是文本在每张幻灯片上的位置完全相同——例如,标题或项目符号列表不会出现在略微不同的位置,因为您在编辑时稍微移动了每个标题或项目符号列表。
对于海报,您也可以使用 LibreOffice,或者再次使用 LaTeX,这次使用 a0poster 包。请记住,如果您选择与海报颜色相匹配的衣服,您将在展示海报时吸引更多的观众!
当涉及到出版时,假设是心理学期刊希望以 Microsoft Word 格式提交,但实际上,大量期刊接受 PDF 提交,许多期刊也接受 LaTeX 文件。例如,Body Image、Journal of Health Psychology 和 Sex Roles 等期刊将接受 LaTeX 提交(Sex Roles 甚至提供 LaTeX 模板)。
研究和研究数据都越来越趋向于开放获取。英国研究委员会将开放获取定义为“对同行评审和已发表的研究论文的无限制在线访问”,并且希望资助接受者与允许这样做的期刊合作出版。一项平行的数据政策规定,数据也应公开提供。各项研究表明,开放获取论文实际上获得了更多的引用,并且与开放数据相关的论文也具有引用优势。
像 Zenodo、Figshare 或 Open Science Framework 这样的数据存储库允许您上传数据集、海报等,并为它们分配 DOI (数字对象标识符),以便可以在引文中引用这些资源。用于专门数据的存储库,例如 功能性磁共振成像 (fMRI) 数据集 也存在。甚至有一本新的开放获取期刊,Journal of Open Psychology Data,专门致力于发表描述具有高重用潜力的心理学数据集的论文。
鼓励
我希望这篇关于免费和开源工具的简短评论能够鼓励学生和研究人员了解可用的工具,无论它们是否可能对他们有用。
一个例子表明了使用开源的好处之一,最近一篇 评论论文 得出结论,实验包 PsychoPy 显示出严重的计时错误,PsychoPy 的首席开发人员能够检查 数据,并在几周内通过文章的 评论页 让作者和读者知道,使用的 PsychoPy 版本已经过时三年,并且更新的版本没有这些问题。
这不仅表明开源开发人员对用户有多么积极响应,而且还表明当数据开放且期刊允许读者发表发表后评论时,可以多么有效地进行更正。开源和开放获取很可能在心理学研究中变得越来越重要,尤其因为它们允许和鼓励这种透明度、可复制性和协作。
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